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糖鎖プロファイリング：グライコミクス研究所｜バイオサイエンスの株式会社モリテックス

アプリケーション

GlycoStation™は、以下のように幅広い分野で活用できるシステムです。

LecChip™で測定できるサンプル、また測定方法も様々です。
GlycoStation™は、簡易的、高感度、液層測定可能といったこれらの特徴ゆえに、汎用性の広いシステムとなっています。

クルードサンプルの測定

GlycoStation™システムでは、細胞のライセート、細胞膜・細胞質画分等の細胞抽出液といったクルードサンプルのディファレンシャル解析が可能です。

その一例として、CHO細胞の膜画分に対するLec1変異細胞のディファレンシャルプロファイリングの結果を示します。

N結合型糖鎖認識レクチンにおいて差異は顕著であり、O結合型認識レクチンでは小さくなっています。

ディファレンシャルプロファイリングにより簡単に得られたいくつかのシグナルデータがあります。分岐した複合型N結合型糖鎖認識レクチン（PHA(L), PHA(E), ACG）、α2,3-Sia認識レクチン（MALⅠ）、ガラクトース認識レクチン（RCA120）のシグナルは、Lec1変異細胞で減少がみられます（左下グラフ参照）。

ハイマンノース型のN結合型糖鎖認識レクチン（GNA, HHL, PWM, Calsepa, PSA, LCA）は、Lec1変異細胞では増加がみられます(右下グラフ参照)。

これらの結果は、Lec1が糖転移酵素GlcNAc-T1の欠損であることから考えて合理的です。

抗体オーバーレイ法

レクチンマイクロアレイでは、抗体オーバーレイ法を用いることで、クルードサンプル中の特定タンパク質の糖鎖を調べることも可能です（右図参照）。

ガン細胞の血小板凝集因子として働くムチンタイプのシアロ糖タンパク質Podplaninの研究においても、その手法は用いられています。

抗体は、Podplaninが誘導した血小板凝集を抑制する高反応性の抗Podplanin抗体NZ-1をビオチン化して用いています。

レクチンマイクロアレイにPodplaninサンプルをアプライして反応後、そこにビオチン化NZ-1を反応させ、Cy3標識ストレプトアビジンでの検出を行っています。

Lec1、Lec2、Lec8に発現させたPodoplaninサンプルでのレクチンマイクロアレイの結果から、シアル化されたcore1構造をもつことが示唆されています。

さらに、15の膠芽細胞腫セルラインのうちポドプラニンの発現が高く、血小板凝集を誘導していたLN319のPodoplaninサンプルの結果から、disialyl-T抗原、sialyl-T 抗原、sialyl-Tn抗原をもつが示唆されています。

生細胞でのグライコーム測定

細胞において、その種類、分化度、悪性変異により、発現している糖鎖全体”グライコーム”が変わるといわれています。
弊社のシステムでは、Cy3標識したタンパク質をサンプルとして、その糖鎖を解析をするのが一般的でした。

しかし、最近の研究では、 CMRA試薬を用いて、細胞に代謝的に標識を行ったサンプルを用いることで、細胞表面に発現している糖鎖全体”グライコーム”を解析することも可能となっています。 つまり、糖タンパク質以外の細胞表面に発現している糖脂質をも含んだ糖鎖全体も解析も可能となっているのです（右図参照）。

CHOとその糖鎖付加欠損変異細胞、また野生型とβ1-3-N-acetylglucosaminyltransferaseIIノックアウトマウスの脾細胞のディファレンシャルプロファイリングで、糖鎖付加の表現型とよく合致される結果が得られています。
さらに、K562細胞の細胞表面糖鎖を分化前後での比較においても、分化した細胞でO結合型糖鎖の発現においての大幅な増加がみられています。

本手法は、哺乳類細胞表面の糖鎖全体”グライコーム”変化のプロファイリングのための革新的なプロトコルであり、生細胞に適用できます。

ホルマリン固定組織片の測定

ホルマリン固定組織片の糖鎖プロファイリング測定プロトコルも確立されています。

正常大腸組織片（n=12）と大腸癌組織片（n=28）の比較で、いくつものレクチンで違いがみられています。中でも、WFAではGradeI＋II,GradeIII共にP<0.0001という結果が得られ、WFAの組織染色の結果との相関性も確認されています。

本手法は、細胞数にしておよそ500個という超高感度な測定方法です（下図参照）。
ホルマリン固定により架橋を十分に解くため、免疫組織染色などで行われている抗原賦活化処理を行うと蛍光標識率を上げることができます。
また、脱パラフィン操作により、糖脂質の除去も行われています。

参考文献

  • 細胞糖タンパク質のディファレンシァルプロファイリングのためのデータマイニングシステム：
    Development of a data-mining system for differential profiling of cell glycoproteins based on lectin microarray, Atsushi Kuno, Yoko Itakura, Masashi Toyoda, Yoriko Takahashi, Masao Yamada, Akihiro Umezawa, and Jun Hirabayashi, Journal of Proteomics & Bioinformatics(JPB),Vol.1,p.68(2008.5)

    詳細ダウンロード：834KB

  • ホルマリン固定組織切片の糖鎖プロファイリング：
    Development of an all-in-one technology for glycan profiling targeting formalin-embedded tissue sections, Atsushi Matsuda, Atsushi Kuno, Hiroyasu Ishida, Toru Kawamoto, Jun-ichi Shoda and Jun Hirabayashi, Biochemical and Biophysical Research Communications,370, p.259 (2008).
  • 糖鎖プロファイリングの時代到来：
    The Era of Glycan Profiling has come: Glycomics's Infinite Potential and Applications to Healthcare, M. Yamada, GOR, Vol.9, No.1, p.16 (2007).

    詳細ダウンロード：2.3MB

  • 生細胞表面のグライコームプロファイリング：
    A novel strategy for mammalian cell surface glycome profiling using lectin microarray, H. Tateno, T. Sato, H. Narimatsu, and J. Hirabayashi, Glycobiology, Vol.17, No.10, p.1138 (2007).
  • 分子間相互作用ハンドブック　タンパク質とタンパク質・核酸・糖・脂質・低分子間のネットワーク解析（礒辺俊明，中山敬一，伊藤隆司/羊土社/2007.9)
    第4章1項　レクチンアレイによる糖タンパク質の解析【久野 敦 平林 淳】
  • 抗体オーバーレイ レクチンマイクロアレイの測定：
    Inhibition of tumor cell-induced platelet aggregation using a novel anti-podaplanin antibody reacting with its platelet-aggregation-stimulating domain, Y. Kato, M. K. Kaneko, A. Kuno, N. Uchiyama, K. Amano, Y. Chiba, Y. Hasegawa, J. Hirabayashi, H. Narimatsu, K. Mishima, and M. Osawa, doi:10.1016/j.bbrc.2006.08.171.
  • クルードサンプルのアプリケーション：
    Application of Lectin Microarray to Crude Samples: Differential Glycan Profiling of Lec Mutants： Youji Ebe, Atsushi Kuno, Noboru Uchiyama, Shiori Koseki-Kuno, Masao, Takashi Sato, Hisashi Narimatsu and Jun Hirabayashi, J Biochem, 139(3), p.323 (2006).
  • フロンタルアフィニティークロマトグラフィー（FAC）:
    High-throughput analysis of lectin-oligosaccharide interactions by automated frontal affinity chromatography, Methods, S. Nakamura-Tsuruta, N. Uchiyama, and J. Hirabayashi, Enzymol., Vol.415, p.311 (2006).
  • 糖鎖プロファイリング技術の原理と性能：
    Evanescent-field fluorescence-assisted lectin microarray: a new strategy for glycan profiling: Atsushi Kuno, Noboru Uchiyama, Shiori Koseki-Kuno1, Youji Ebe, Seigo Takashima, Masao Yamada & Jun Hirabayashi, Nature Methods Vol.2, No.11, p.851 (2005).

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