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ChIP解析
Illumina Genome AnalyzerII(旧Solexa)を用いてChIP解析を実施致します。
従来Tilling Arrayのような、非常に高価なシステムでしか実現出来なかった解析ですが、本サービスをご利用頂ければ、免疫沈降後のDNAをお送り頂くだけで、全ゲノムを対象としたChIP解析を行えます。
メチル化解析などにも利用可能です。
- お送り頂くサンプルについて
- 免疫沈降後のDNA 150ngを、450µLの超純水に溶かして下さい。
- ※ DNA量が上記に満たない場合でも実験が可能な場合もございます。別途ご相談下さい。
- ※ Real-Time PCRなどで、免疫沈降が成功していることを事前に確認されることをお勧め致します。免疫沈降自体が上手く行っていない場合、全くデータが得られません。
その場合でも、全額をご請求させて頂きますので、ご注意下さい。
オプション解析
- GFFファイル出力(ゲノムブラウザを使用するため)
USCSゲノムブラウザなどにアップロードするための、GFFファイルをご提供します。 - ChIP解析(通常、必ずご利用下さい。)
得られたタグのマッピングとタグ数のカウントを行います。 - ターゲット領域のアノテーション
ターゲット領域のアノテーションを行います。 - モチーフ解析
ターゲット領域のモチーフ解析を行います。 - ターゲット遺伝子の機能解析
Gene Ontology等を利用した機能解析を行います。
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